两虫是2种严重危害水质安全的致病性单细胞原生动物，其卵囊或孢囊具有个体微小、致病剂量低、抵抗环境选择性压力强、易造成两虫病爆发流行等特点，呈多发性分布，因而需要用
两虫检测系统进行检测以保证水质。
为什么要进行“两虫”检测？
首先，便于协同调整水处理方案，水中两虫越多就需更多的处理以期降低其在水中的含量。
其次，保护公众，因为两虫会影响饮用者身体健康，感染疾病后的救治成本远高于提前预防成本；
另外，一旦发生规模性感染，供水公司必将承担相应的法律责任。
两虫检测系统检测方法：
1.MF方法
水分析的典型的MF方法是通过使已知体积的水通过孔径足够小以消除细菌细胞（通常为0.45μm）的无菌膜过滤器来进行的。然后将过滤器无菌地转移到琼脂板的表面或用合适的选择性培养基饱和的吸收垫。允许在过滤器的表面上发育，并且可以直接计数和检查。MF方法快速且易于执行，需要很少的孵化器空间，并且可以处理非常大量的水。在过去30年中两虫检测系统已经成为用于指示生物的水的微生物检查的方法。
2.快速检测方法
虽然微生物水分析的大多数人仍然依赖于传统的培养方法和MF方法。但获得结果所需的时间比较长，对于一些特定的微生物我们可以使用一些快速分析法，比如利用定量PCR（QPCR）技术的方法可以快速检测指示生物菌和特定病原体，尤其是在MF分析法相结合时是快速有效的手段，但检测一些没有活性细胞时数据会偏高。
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